Biostatistics and Informatics Core

Baylor College Of Medicine, Houston TX

Investigators

Linked publications & trials

Abstract

Project Summary     Long  before  the  inception  of  PDXNet,  the  BCM  group  comprising  the  Biostatistics  and  Informatics  Core  (BIC)  was  supporting  PDX  collection,  characterization,  and  annotation,  and  design  and  analysis  of  PDX  trials.  M-­ PDTC  BIC  members  are  also  members  of  the  Dan  L  Duncan  Comprehensive  Cancer  Center?s  (DLDCCC)  Biostatistics  and  Informatics  Shared  Resource  at  BCM,  which  is  led  by  Dr.  Hilsenbeck.  This  also  allows  us  to  leverage resources and expertise in the Shared Resource, as needed, to address unanticipated needs.   The  goals  of  the  Biostatistics  and  Informatics  Core,  which  are  specifically  focused  on  biostatistics  and  data  management,  are:  1)  To  assist  the  BCM  M-­PDTC  with  compiling,  curating,  analyzing,  transmitting,  and  receiving  data  to/from  investigators,  other  PDTCs,  the  coordinating  center  (PDCCC),  and  the  patient-­derived  model    repository  (PDMR);?  and  2)  To  assist  BCM  M-­PDTC  research  projects  and  pilot  projects  with  statistical  methods,  PDX  trial  design,  and  integration/interpretation  of  complex  data  sets  in  collaboration  with  PDTC  members.   With  expertise  in  statistical  methods,  trial  design,  insight  into  integration  and  interpretation  of  complex  data  sets, and expertise and tools for biomedical informatics and data management, we will help support the goal of  the  PDXnet  of  correlating  genomic  characterization  data  of  PDX  models  used  in  the  research  projects  with  drug  response  data  to  identify  tumor  subsets  and patient  populations  that  may  benefit  from  a  particular  drug  combination.  The  proposed  Biostatistics  and  Informatics  Core  (BIC)  is  an  expansion,  at  BCM,  of  the  Bioinformatics  and  Biostatistics  Core  in  our  Breast  Cancer  PDTC  (PIs:  Welm,  Welm  and  Lewis).  The  expansion  is  necessary  to  support extension of critical biostatistical and informatic services to this Minority PDTC. The close relationship  between  the  two  Cores  ensures  the  use  of  common  practices  for  data  management,  allows  us  to  leverage  development  of  data  sharing  processes,  and  ensures  the  use  of  cross-­PDTC  standardized  experimental  designs and analysis methods wherever possible.