Pan-HIV Incidence Assay Development

Immport Therapeutics, Inc., Irvine CA

Investigators

Abstract

Pan-­HIV Incidence Assay Development    Abstract    HIV-­1 continues to cause the largest number of yearly deaths from a single infectious agent in the world today.  Despite  considerable  advances  in  treatment  of  HIV-­1  infection  and  AIDS,  which  it  causes,  there  is  an  urgent  need for better methods of prevention and treatment of HIV-­1 infection and AIDS. As part of this effort, the World  Health Organization (WHO) and the Joint United Nations Program on HIV/AIDS (UNAIDS) conduct worldwide  surveys of HIV infection incidence, prevalence and mortality. Incidence data are vitally needed by governments  and  non-­governmental  organizations  to  best  direct  efforts  and  limited  resources  aimed  at  prevention  of  HIV  transmission and treatment of HIV infection. The limiting antigen avidity enzyme immunoassay (Lag assay) is  currently widely used to test for HIV incidence but this assay only detects very recent infections and does not  work well for all subtypes of HIV-­1.     Antigen Discovery Inc. (ADI), of Irvine California, has created a pan-­HIV proteomic microarray (pan-­HIV chip)  that  contains  all  proteins  and  many  protein  fragments  and  epitopes  from  nine  HIV-­1  subtypes  and  circulating  recombinant forms as well as both major groups of HIV-­2, which together comprise over 90% of HIV infections  worldwide.  We  also  added  glycosylated  and  disulfide-­bound  forms  of  HIV  glycoproteins  and  glycoprotein  fragments  resulting  in  a  total  of  over  280  immunoreactive  HIV  proteins,  proteins  fragments  and  epitopes.  Moreover, we assayed the reactivity of this HIV protein microarray with IgG, IgA and IgM in a panel of 125 sera  and saliva samples, obtained from the Consortium for the Evaluation and Performance of HIV Incidence Assays  (CEPHIA),  that  comprise  the  HIV  Recency  Biomarker  Screening  (HRBS)  set.  Our  preliminary  data  show  that  certain HIV antigens, Vif, Vpu, p6, Tat, Rev, Env and Env fragments are much less strongly recognized by IgG  in sera and saliva from recently infected individuals compared to those with longer-­term infection. In contrast,  Env, Env fragments, Tat, Rev, CA and PR are more strongly recognized by IgM in sera and saliva from recently  infected individuals compared to those with longer-­term infection. Based on these extensive preliminary data,  we  hypothesize  that  we  can  develop  a  highly  sensitive  and  specific  HIV  recency  of  infection  testing  algorithm (RITA) that will be useful for individuals infected with all types and subtypes of HIV.